「僕が愛したすべての君へ」では、母と暮らす高校生の高崎暦がクラスメイトの瀧川和音に声をかけられたことから物語が始まります。彼女は85番目の並行世界からやってきたと言い、彼らがその世界では恋人同士であることを告げます。この出会いをきっかけに、高崎暦は新たな世界の謎に迫っていくことになります。